Bio je to prvi susret s papom Lavom XIV., a četvrti s jednim papom, od njegova izbora prije dvadeset pet godina. Audijencija je održana u Villi Barberini, papinskoj rezidenciji u Castel Gandolfu, gdje se papa Lav XIV. nalazi od sinoć. Susret je protekao u bratskom i srdačnom ozračju, a na susretu se razgovaralo o raznim crkvenim pitanjima.

Uz katolikosa bili su prisutni svi članovi delegacije koji su ga pratili tijekom posjeta Rimu. Svi su potom otišli u Vatikan, gdje se patrijarh susreo s kardinalom Kurtom Kochom, prefektom Dikasterija za promicanje jedinstva kršćana, i kardinalom Joséom Tolentinom de Mendonçom, prefektom Dikasterija za kulturu i obrazovanje. U programu je bio i posjet bazilici svete Marije Velike, gdje je Karekin II. odao počast papi Franji, s kojim je uspostavio odnos dijaloga i prijateljstva, te se pomolio na njegovom grobu. Nakon toga se zadržao pred Gospinom slikom Salus Populi Romani.

Ovaj susret u Vatikanu prvi je susret pape Lava XIV. i Karekina II., koji je prvi put posjetio Rim 9. i 10. studenog 2000., kada je, tada novoizabrani katolikos svih Armenaca, bio gost svetoga Ivana Pavla II. povodom Jubileja 2000. Tijekom tog posjeta, slijedom izjave koju su 12. svibnja 1970. potpisali sveti Pavao VI. i Njegova Svetost Vasken I., potpisana je Zajednička izjava: korak na putu, koji još uvijek traje, prema ponovnoj uspostavi punoga zajedništva između dviju Crkava.

Katolikos Karekin II. ponovno je bio u Vatikanu od 6. do 9. svibnja 2008., na poziv Benedikta XVI., kako bi sudjelovao u ekumenskom slavlju kojim je predsjedavao Papa. Potom je ponovno došao 12. travnja 2015., za vrijeme pontifikata pape Franje koji je pozvao poglavara Armenske Crkve iz Ečmidazina da bude uz njega tijekom mise slavljene u bazilici svetoga Petra u spomen na armenske mučenike iz 1915. godine. Tijekom tog slavlja papa Franjo je proglasio svetoga Grgura iz Nareka naučiteljem opće Crkve. Bio je to vrlo značajan trenutak za cijelu Armensku Crkvu.

Slijedeći primjer pape Wojtyłe, i papa Bergoglio je pohodio Armeniju od 24. do 26. lipnja 2016. godine. Argentinski papa odao je počast „prvoj kršćanskoj zemlji“ – kako je glasilo geslo njegova apostolskog putovanja – 2018. godine, kada je u Vatikanskim vrtovima otkrio kip svetoga Grgura iz Nareka. Karekin II. bio je nazočan toga dana, zajedno s tadašnjim predsjednikom Republike Armenije Serzhom Sargsyanom.

Iste godine u listopadu, Karekin II. ponovno je posjetio papu Franju i susreo se s brojnim predstavnicima Rimske kurije. Još je jedan sastanak održan u rujnu 2020., a tom je prilikom katolikos Papi predstavio stanje nakon vojnih operacija u Artsahu. Pritom je istaknuo važnost papinih poziva za prekid sukoba i ponovno uspostavljanje mira.