Primivši u audijenciju nadbiskupa Edgara Peñu Parru, zamjenika za opće poslove Državnoga tajništva Svete Stolice, papa Lav XIV. odredio je odobravanje novoga statuta Papinske međunarodne marijanske akademije, imajući u vidu potrebu usklađivanja njezina normativnog ustroja s razvojem vlastitoga poslanja te s važećim ustrojem kurijalnih institucija.

Papa Franjo u poruci Papinskim akademijama od 4. prosinca 2019. istaknuo je da je Akademija sve do danas pratila opće učiteljstvo Crkve istraživanjem i koordinacijom marioloških studija, ostvarujući pritom suradnju s različitim akademskim ustanovama te pružajući jasno svjedočanstvo o tome kako je mariologija nužna prisutnost u dijalogu među kulturama, sposobna poticati bratstvo i mir.

Papinsku međunarodnu marijansku akademiju osnovao je 1946. godine Red manje braće, zajedno s Komisijom Mariana Franciscana, s ciljem organizacije marioloških studija i marijanske pobožnosti unutar Reda. Te su dvije ustanove povjerene vodstvu njihova utemeljitelja fra Karla Balića, koji je u to vrijeme bio rektor Papinskoga sveučilišta Antonianum i nositelj katedre za mariologiju. Od 1950. godine Sveta Stolica povjerila je Marijanskoj akademiji organizaciju Međunarodnih mariološko-marijanskih kongresa.

Dana 8. prosinca 1959. sveti papa Ivan XXIII. motuproprijem Maiora in dies, prepoznavši da je Akademija svojim djelovanjem pridonijela napretku marijanske doktrine i pobožnosti, dodijelio joj je naslov „papinska“. Time joj je povjerio trajnu organizaciju Međunarodnih mariološko-marijanskih kongresa, koordinaciju i susrete mariologa iz cijeloga svijeta te ponovno istaknuo njezinu zadaću promicanja i poticanja studija o Blaženoj Djevici Mariji, s ciljem produbljivanja mariologije i promicanja autentične marijanske pobožnosti. Tako je nastala Papinska međunarodna marijanska akademija.

Od samoga početka institucija je bila pod nadležnošću Vrhovne svete kongregacije Svetoga oficija, današnjega Dikasterija za nauk vjere. Prema Statutima iz 1997. godine, koordinacija njezinih aktivnosti s djelovanjem ostalih Papinskih akademija bila je povjerena Papinskom vijeću za kulturu. Apostolskom konstitucijom Praedicate Evangelium ta je zadaća povjerena Dikasteriju za kulturu i obrazovanje.

Budući da je nastala unutar Reda manje braće pri Papinskom sveučilištu Antonianum, Papinska međunarodna marijanska akademija pridružena je tom sveučilištu 18. svibnja 1972. godine kao ustanova specijalizirana za područje mariologije. Papinskoj međunarodnoj marijanskoj akademiji 4. prosinca 2012. godine pridružila se i Papinska akademija Bezgrešne.