Prva detaljna analiza genoma virusa SARS-CoV-2, uzročnika bolesti COVID-19, provedena je na Institutu Ruđer Bošković (IRB) u Laboratoriju za naprednu genomiku pod vodstvom dr. sc. Olivera Vugreka, a u suradnji s izv. prof. Igorom Jurakom s Odjela za biotehnologiju Sveučilišta u Rijeci te prof. dr. sc. Tomislavom Rukavinom i dr. med. Nevenom Sučićem s Medicinskog fakulteta u Rijeci i Nastavnog zavoda za javno zdravstvo u Rijeci.

Uspostavljanje platforme za analizu te određivanje genoma virusa ima višestruki značaj jer će omogućiti detaljno praćenje evolucije virusa i puteve prijenosa virusa, a što je od iznimnog značaja za razvoj novih lijekova i cjepiva u budućnosti.

Dr. sc. Oliver Vugrek. Foto: Institut Ruđer Bošković

”Naš Laboratorij za naprednu genomiku na IRB-u jedan je od vodećih laboratorija u Hrvatskoj za primjenu modernih tehnologija za analizu gena baziranom na masovnom paralelnom sekvenciranju (eng. NGS). Ovakav pristup, koji omogućava istovremenu analizu velikog broja gena, naš laboratorij već duži niz godina uspješno primjenjuje za određivanje genetskih uzročnika nasljednih bolesti i genetike raka koja je sada prilagođena za određivanje genoma virusa,” objašnjava dr. sc. Oliver Vugrek, voditelj laboratorija.

izv. prof. Igor Jurak

Značaj ovog rezultata za istraživače s IRB-a tim je veći jer je tim pod vodstvom dr. Vugreka razvio vlastiti protokol za analizu uzročnika bolesti COVID-19 koji bi mogao biti široko primjenjiv i za analize drugih virusa.

”Požrtvovni rad i domišljatost doktoranda mag. chem. Filipa Rokića omogućio je implementaciju i eksperimentalnu izvedbu protokola za sekvenciranje. Važno je napomenuti da ovakav pristup generira ogromnu količinu podataka koju je moguće analizirati samo uz pomoć sofisticiranih bioinformatičkih alata za koje je bio zadužen još jedan doktorand u laboratoriju, mag. mol biol. Lovro Trgovec-Greif,” ističe dr. Vugrek.

U ovom istraživanju esencijalno je bilo sudjelovanje prof. dr. Tomislava Rukavine i dr. med. Nevena Sučića s Nastavnog zavoda za javno zdravstvo u Rijeci te Medicinskog fakulteta u Rijeci koji su sakupili uzorke pacijenata i proveli dijagnostičku analizu pomoću metode PCR-a. Prof. Rukavina je jedan od vodećih stručnjaka u području epidemiologije te voditelj Laboratorija za molekularnu dijagnostiku.

Doktorand mag. chem. Filip Rokić. Foto: Institut Ruđer Bošković

”Povezivanje genetike virusa s epidemiološkim podacima omogućit će jasno određivanje izvora zaraze te praćenje širenja zaraze širom Hrvatske. Vrlo je važno razumijevanje putova ulaska virusa u Hrvatsku tijekom ove epidemije, ali i eventualnih budućih, kako bi se moglo na vrijeme djelovati i prevenirati ih.” ističe prof. Rukavina.

Projekt analize genoma virusa koordinirao je izv. prof. Igor Jurak s Odjela za biotehnologiju Sveučilišta u Rijeci i voditelj Laboratorija za molekularnu virologiju. Igor Jurak ima više od dvadeset godina iskustva u istraživanju biologija virusa, posebice biologije herpes simplex virusa. U tijeku epidemije laboratorij je preusmjerio svoj interes na istraživanje koronavirusa kako bi svojim višegodišnjim iskustvom mogli doprinijeti suzbijanju pandemije COVID-19.