Posljednji ulazak je u 12.30 sati. Karte nije moguće rezervirati unaprijed, broj posjetitelja je ograničen. No, moguće je unaprijed rezervirati pojedinačno ili skupno razgledavanje pod stručnim vodstvom, koje je na taj način i jeftinije. Dostupno je trosatno vodstvo na talijanskom i engleskom jeziku. Ulaznica za muzeje u pravilu stoji 17 eura, sa sniženjem 8 eura plus cijena rezervacije.

U skladu s epidemiološkim propisima u Italiji, za ulazak u Vatikanske muzeje također je obvezna „zelena karta” i FFP2 maska. Dokumenti moraju sadržavati potvrde o punom cijepljenju ili preboljenju Covid 19. Priznaju se i nacionalne digitalne Covid potvrde.